La División de Estudios de Posgrado brinda el mayor número de programas de especialización en el país, cuenta con 78 especializaciones médicas, de las cuales 24 son de entrada directa a través del Examen Nacional de Aspirantes a Residencias Médicas, las 54 restantes son de entrada indirecta y requieren de estudios previos de especialización. Algunos de estos programas son exclusivos de la Universidad Nacional Autónoma de México y se imparten en las mejores instituciones de salud del país, pues la División cuenta con 106 sedes académicas donde se imparten 601 cursos de especialización.